安捷伦 Cary 60 紫外-可见分光光度计配 置微光纤 探头测定 4 °颁 下微量 DNA 的 纯度
应用摘要 医药/生物技术 |
总结 |
安捷伦 Cary 60 紫外-可见分光光度计是在储存环境(如冰箱)下直接测定微量生 |
物样品的理想仪器。本应用报告展示了如何使用 Cary 60 及其微光纤探头附件测 定 4 °颁 下 的 DNA 纯度——结果表明,使用该仪器能够大幅节省时间和成本,同 时数据精确度和重现性毫无损 失。 |
• 不再需要比色皿 |
• 直接测定 4 °颁 冰箱中的样品 • 节省每次分析的时间与成本 前言 多年以来,紫外-可见分光光度计一直是生物技术领域中测定 DNA 纯度和浓度的 一项重要工具。该 方法最早由 Warburg 和 Christian 在 1942 年开发 1,随后由 Sambrook 等人在 1989 年进行了 优化,使其可用于实验室中简便、快速的测定 2。 分光光度法的主要优点在于测定过程: 1) 简便; 2) 准确; 3) 不破坏样品。这一 方法可以节省时间而不损失数据质量,并且在测定过程中无需使用大 体积的样 品或额外的耗材,从而带来经济效益。 |
在之前的文章中,我们介绍了安捷伦 Cary 50 紫外-可见分 光光度计配置 Hellma(德国 Hellma GmbH & Co.)的 Traycell 微量比色
池紫外-可见在室温下准确、可重现地测 定微量 DNA 的方法 3。在本研究中,我们采用带光纤探头的 Cary 60 紫外-可见分光光度计进
行了方法扩展研究,在 4 。颁 以及普通实验室环境光照条件下测定了小体积样品。本方 法使得用户可以将仪器靠近样品,而不是像传
统光谱方法 那样将样品放入仪器中,从而能够在很短的时间内完成分 析。Cary 60 的光学设计使这一优势得以实现,它主要凭 借
其的高强度闪烁氙灯以及最新型的电子器件,使系 统能够有效地监控吸光度的微小变化而不受环境背景光的 任何影响。本文深入
讨论了这一方法的主要优点。
仪器与材料
部件号 | 说明 |
G6860AA
7910035600 G6866A 6610000800 D-4764(Sigma 化学公司) | Cary 60 紫外-可见分光光度计,配备 WinUV 软件和 HP 电脑(台式机) 微光纤探头 光纤探头耦合器 石英比色皿(光程 1 cm;两只装) 小牛胸腺 DNA;1 |
方法与结果
将小牛胸腺 DNA 用纯净水(MilliQ)稀释得到不同浓度的样 品,浓度范围 0–50 µg/ml。
配有光纤耦合器以及微探头的 Cary 60, 如图 1 所示。在 Eppendorf 管中加入 150 µL 纯净水(MilliQ),将其读数作为 空白。
由于分子生物学试剂通常保存于冷藏条件下,因此所有样 品直接从 4 。颁 冰箱中取出并进行分析。
图 1. 配有光纤附件的 Cary 60 测试 4 。颁 下 Eppendorf 管中 150 μ尝 DNA 的示意 图。
开始时,使用 WinUV 软件“扫描"模块在 340 到 240 nm 范 围进行扫描以确认最大吸收峰以及所购买的按 50:50 稀释 的 DNA 样品的可靠性(图 2)。
波长(nm) |
图 2. 对 4 。颁 下两个浓度的 150 µL DNA 样品的扫描表明特征吸收峰出现在 260 nm 处。注意:50 µg/ml DNA 最大吸光度值 1.0Abs,25 µg/ml DNA 最大吸光度 值 0.5Abs,遵守 Beer Lambert 定律(A = ε肠濒)。
为 了 确 认 DNA 的 纯&苍产蝉辫;度 ,使 用 WinUV 软 件 专 门 的 “RNA/DNA"模块测定 260/280 比率,该模块可自动计算 DNA 样品的纯
度。如图3 所示,这一模块使用非常简单,可 以在一分钟内完成分析。
图 3. 简便、专用的 Cary WinUV 自动计算 DNA 的纯度、可靠性和浓度
最后,绘制浓度曲线以评估同一实验室条件下不同浓度 DNA 样品读数的线性和重现性(图4)。在两个 DNA 样品读 数间隙使
用 MilliQ 纯净水清洗微探头。
讨论
测定五个样品所用的时间不到两分钟。传统方法使用微量 比色皿,需要等待样品加热至室温,而且在每两次测定间 需要清洗微量比色
皿。总之,使用 Cary 60 光纤系统可以显 着降低大约 80% 的分析时间,同时采用光纤技术不易受到 样品处理引起的潜在污染。使用微
探头可以获得高精度的 数据并大大缩短测定低温样品所需的时间,这表明 Cary 60 是一种适于测定生物样品(如 DNA)的简便、快速且
高性价 比的系统。本方法可以轻松地直接扩展到其它样品类型, 例如可在 280 nm 处测定蛋白质。
结论
Cary 60 紫外-可见分光光度计是使用光纤采样的理想仪器, 它的高强度闪烁氙灯可以提供的灵敏度和重现性。 本应用报告所展示的测
定 DNA 样品时的分析速度、结果重 现性以及易用性证明了该仪器系统的强大优势。
使用带光纤的 Cary 60 分析生物样品还具有如下优点:
• 可以直接测定高温或低温样品(4 °颁 – 110 °颁)而无需 考虑冷凝的问题,如果使用比色皿则由于冷凝可能导 致结果不正确或重现性不好
• 样品体积不受限制,可以低至 40 µL,也可以无限大
• 无需购买昂贵的石英微量比色皿,更节省了清洗比色 皿的时间
• 使用反射探头还可以分析固体、粉末或凝胶类样品
图 4. 使用微探头光纤附件在实验室常规光照条件下测定 4 °颁 下 Eppendorf 管中 50 µL DNA 样品(0–
50 µg/mL)得到的浓度曲线。校准方程:Abs = 0.02393*浓 度;相关系数 = 0.99126。